По тем или иным причинам, а с возрастом тем более, происходят структурные перестройки микробиома человека, что отчасти приводит к потере возможности организма регулировать поддержание количественного и качественного состава микроорганизмов внутри и на поверхности тела. Микробиом человека, непосредственно участвующий во всех биохимических и физиологических процессах организма, порой может влиять и на его поведенческие реакции, как-то: водобоязнь, отдельные виды шизофрении и некоторые другие психопатологии. Отсюда всякого рода сдвиги внутри микробиома могут нести за собой физические недомогания, физиологические отклонения и психические страдания. Практически человек является «полем битвы» конкурирующих между собой, полезных и вредных паразитов, облигатных и факультативных симбионтов и даже тех, кто использует человека как средство перемещения.